猪的霉玉米中毒症与呕吐毒素（DON）有关。临床表现包括：拒食（这种毒素使得谷物对猪的适口性非常差）、增重减慢甚至体重减少、传染病的发病率增加和消化道紊乱，包括腹泻、呕吐（故DON又被称为呕吐毒素）。其它所观察到的临床症状包括成年母猪不发情、配种效率降低、哺乳仔猪的高死亡率、消化道炎症以及幼龄仔猪的急性腹泻。幼龄仔猪剖检可见腹腔出血。

T-2毒素是影响猪的生产性能的另一种霉菌毒素。病例研究表明该毒素及其相关的化合物在饲料中的浓度为200ppb或更少时，就会引起猪的生产性能降低。采食1-2ppm的T-2毒素就会引起子宫和卵巢损伤，造成不育。

赭曲霉毒素A（OTA）对猪肾脏的损害非常具有特征性，被称作猪肾病，在屠宰场易于辨认。OTA会损害公猪的生殖能力，并具有致畸性，但只有在毒素浓度极高的情况下才会出现这种症状。OTA可以穿过胎盘屏障，从而损害胎儿的正常发育，比如初产仔猪尾巴坏死可能就是OTA中毒的结果。饲料中赭曲霉毒素污染所造成的经济损失不仅局限于它对动物健康和繁殖性能造成的不利影响，还包括这种猪的胴体因不能食用而废弃。因为与血清蛋白的亲和力高，该毒素的生物学半衰期很长，因而在人们所消费的猪肉及其制品中经常可以发现残留。

猪的烟曲霉毒素B1中毒的主要症状就是胸膜水肿（猪肺水肿，PPE），从而对呼吸功能和心脏功能造成损害。